Во время Великой Отечественной войны институт активно поддерживал оборонную промышленность, разрабатывая усовершенствования для металлорежущих станков и исследования свойств брони. В 1941 году часть студентов и преподавателей была эвакуирована в Томск, где на базе института создали филиал. К 1950-м годам в институте сложились научные школы, а число преподавателей с учеными степенями значительно возросло.

С 1960-х годов институт сосредоточился на адаптивном управлении производственными процессами, автоматизации и создании новых моделей станков. В 1980 году, в честь 50-летия, институт был награжден орденом Трудового Красного Знамени за заслуги в подготовке инженерных кадров. К этому времени вуз подготовил свыше 18 тысяч инженеров и стал ведущим научным центром в области машиностроения.

В 1992 году институт получил статус университета и новое название – Московский государственный технологический университет «СТАНКИН». В 1994 году был открыт факультет экономики и менеджмента, а также факультет механики и управления. В 2008 году при университете создан Государственный инжиниринговый центр для поддержки российской промышленности.

Сегодня МГТУ «СТАНКИН» поддерживает международные связи и продолжает развиваться, внедряя инновации и укрепляя позиции среди технических вузов России. В университете работают более 500 преподавателей, включая докторов наук, и ведется подготовка специалистов для передовых отраслей промышленности.